Als sein Œuvre im engeren Sinne läßt sich die philologisch - kritische Sichtung der Texte jüdischer Mystik bezeichnen, welche oft unter dem eher unklaren Namen Kabbala zusammengefaßt werden. Mehr als 15 Jahre des akademischen Wirkens Scholems waren der systematischen Findung und Wertung kabbalistischer Texte in den Bibliotheken und Archiven Europas gewidmet, bevor er an die Aufbereitung des gewaltigen Materials ging. Verschiedene Arbeitsweisen des Historikers: Heuristik und Analyse, Sytematisierung und Synthese hat Scholem in geradezu vorbildlich sturer Selbstbeschränkung durchgeführt, allerdings nicht ohne manchen Seitenhieb auf andere Forscher und ihre Methoden. Er blieb gegenüber ideologischen und wissenschaftlichen Methoden seiner Zeit nahezu immun und lehnte trotz seiner kontinuierlichen Bereitschaft zur Mitarbeit an interdisziplinären Diskussionsrunden, wie z.B. den Treffen der Eranos - Gesellschaft eine Übernahme ahistorischer Sichtweisen bei der Betrachtung jüdischer Ideengeschichte ab. Sein fachübergreifend inspirierendes Charisma befindet sich gegenüber dieser Sensibilität für Abgrenzung in einem gewissen Widerspruch.

Einen Versuch zur Entwirrung dieses scheinbaren Paradox´ gibt Amos Funkenstein im Tagungsband (es 1989) einer Berliner Konferenz, die im Gedenken an den zehn Jahre zuvor verstorbenen Professor für jüdische Mystik an der Hebräischen Universität im Rahmen der Ausstellung Jüdische Lebenswelten stattfand. Scholems Auseinandersetzung mit den Fragen der Autoren und Kompilatoren kabbalistischer Codices geriet zu einem Hinweis auf die Aktualität längst vergessener Texte, behauptet Funkenstein. Im hochsensitiven Spannungsfeld der europäischen Zeitgenossen Scholems sei die Sicht der wechselseitigen Prägung von Kabbala und den Zeitumständen ihrer Entstehung wie auch ihrer Tradierung als Deutung des eigenen Jahrhunderts und seiner Erfahrungen verstanden worden. Scholems geistige Autorität rührt nach Funkenstein trotz aller von ihm selbst geliebten Kontroversen um sein Werk, welche Scholems Deutungen heute teilweise überholt erscheinen lassen, von seinem angeblich außerordentlich hellsichtigen Zeitbewußtsein her, daß ihm Werk und Geschichtsbild erleuchtet habe.

Ein Wissenschaftler, der seine Bücher neu binden ließ, nachdem durch Einfügung leerer Blätter Platz zur Revision und zum Kommentar geschaffen worden war, sollte wenigstens wegen seiner Fähigkeit zur Selbstironie heutige Studentinnen und Studenten inspirieren.